Այսպես կոչված թռչող ձկները գոյություն ունեն, բայց նրանք թռչունների պես չեն սավառնում երկնքում, այլ կարող են միայն կարճ ժամանակով դուրս թռչել ջրից: Flappy Fish խաղի հերոսուհին սովորական ծաղրածու ձուկ է, ով հայտնվում է դժվարին իրավիճակում։ Նա որոշեց փոխել իր դոզանը, քանի որ այնտեղ, որտեղ նա ապրում էր նախկինում, շատ ավելի վատացել էր: Ջուրը խցանված է, ստորջրյա բույսերը չեն զարգանում, ամեն ինչ մեռնում է, և սնունդ գտնելն ավելի ու ավելի է դժվարանում։ Սա ստիպեց ձկներին գնալ ավելի լավ կյանք փնտրելու։ Սակայն ճանապարհին կային ահավոր խոչընդոտներ՝ շղթաներով խարիսխների տեսքով։ Խեղճը երբեք նման բան չէր տեսել։ Դուք ստիպված կլինեք անցնել այս ճանապարհը սուր խարիսխների միջև և պետք է օգնեք ձկներին Flappy Fish-ում: