Fish Story 2 խաղի երկրորդ մասում դուք կշարունակեք որպես ջրահարս հավաքել տարբեր տեսակի իրեր և ձկներ, որոնք գոյություն ունեն ստորջրյա թագավորությունում: Ձեր առջև էկրանին կտեսնեք խաղադաշտի որոշակի ձև, որը ներսում կբաժանվի հավասար թվով բջիջների: Դրանք բոլորը լցված կլինեն տարբեր իրերով։ Դուք ստիպված կլինեք ուշադիր ուսումնասիրել ամեն ինչ և գտնել միանման առարկաների կլաստեր: Տեղափոխելով առարկաներից մեկը մեկ բջիջ ցանկացած ուղղությամբ, դուք պետք է միանման առարկաներից կազմեք առնվազն երեք կտորից բաղկացած մեկ շարք: Հենց այդպիսի շարք կազմվի, այն կվերանա խաղադաշտից և դրա համար ձեզ միավորներ կտրվեն Fish Story 2 խաղում:
