Մարիոն ոգևորված չէ Հելոուինով, քանի որ սովորաբար այս պահին բոլոր չար ոգիները ակտիվանում են Սնկի թագավորության տարածքներում, և Բոուզերը ազատում է իր բոլոր մինիոններին՝ խառնաշփոթ ստեղծելու համար: Super Mario Flash Halloween տարբերակում դուք կօգնեք Մարիոյին գտնել բոլոր չարագործներին և ավարտին հասցնել նրանց՝ ցատկելով վերևից: Հերոսի բոլոր ընկերները և նույնիսկ Լուիջիի եղբայրը թաքնվում են տանը և քիթը դուրս չեն հանում, միայն խիզախ ջրմուղագործը չի վախենում ոչ մեկից։ Եվ դրա համար պատճառ կա՝ դա դու ես՝ արագաշարժ խաղացողը, ով կվերահսկես հերոսին և թույլ չես տա, որ նա սխալվի Super Mario Flash Halloween տարբերակում: