Հին դևը դուրս եկավ գերությունից և իր կամակատարների բանակի հետ ավերեց Ճապոնիայում գտնվող մարդկային բնակավայրը։ Քաջարի նինձա մարտիկ Կիոտոն որոշեց վրեժխնդիր լինել իր հարազատներից և ոչնչացնել խավարի բանակը և այն առաջնորդող դևին: Դուք Shadow Ninja Revenge խաղում նրան կօգնի այս արկածախնդրության մեջ: Նախքան էկրանին տեսանելի կլինի որոշակի տարածք, որտեղ ձեր բնավորությունը կգտնվի: Օգտագործելով կառավարման ստեղները՝ դուք կառաջնորդեք նրա գործողությունները: Ձեր նինջան առաջ կվազի և կհավաքի տարբեր օգտակար իրեր, որոնք ցրված են ամբողջ ճանապարհին: Նրա ճանապարհին կլինեն տարբեր խոչընդոտներ և թակարդներ, որոնց վրայով նա ստիպված կլինի ցատկել փախուստի ժամանակ: Հանդիպելով հակառակորդներից մեկին, ձեր հերոսը խիզախորեն դուրս կգա պայքարի մեջ: Օգտագործելով սուր և զանազան նետող զենքեր, նա ստիպված կլինի ոչնչացնել թշնամուն: