Պատերազմ սկսվեց ձեր երկրի և հարևան պետության միջև: Atari Missile Command խաղում դուք հրաման կտաք պաշտպանել այն ռազմաբազան, որտեղ ծառայում եք: Էկրանի վրա ձեր առջև կտեսնեք ամեն տեղ տեղադրված ձեր բազայի շենքերը և հրթիռային զենքերը: Թշնամին հրթիռների զանգված է արձակել ձեր բազայի ուղղությամբ, որոնք դուք կհայտնվեք երկնքում: Դուք ստիպված կլինեք կրակել նրանց բոլորին և կանխել նրանց ընկնելը բազայի տարածքում: Դա անելու համար, մկնիկի միջոցով, կապույտ խաչերի օգնությամբ դուք կտեղադրեք ձեր տեղադրությունների տեսողությունը: Բացեք կրակը, երբ պատրաստ եք: Եթե ձեր տեսողությունը ճշգրիտ է, ապա դուք կխփեք թշնամու հրթիռները և միավորներ կստանաք դրա համար: Կուտակելով դրանց որոշակի քանակ ՝ դուք նորացնում եք ձեր կայանքներն ու զինամթերքը նրանց համար: