Մեկ այլ դեպք հետաքննելիս Mystery Subway Escape 2 խաղի հերոսը՝ հետախույզ Մայքլը, գաղտնի մուտք է գտել դեպի լքված մետրոյի կայարաններ։ Նրանց մասին քչերը գիտեն։ Խոսքը տեխնիկական թունելների մասին չէ, այլ այն կայանների, որոնք ժամանակին գործել են, բայց այս կամ այն պատճառով պարզվել են փակ ու չպահանջված։ Այնտեղ մնացել էին որոշ սարքավորումներ, իրեր և իրեր, որոնք դեն չեն նետվել, քանի որ դրանք դեռ կարող են օգտակար լինել: Հենց այնտեղ է, որ մեր հերոսը ապացույցներ է փնտրելու, իսկ հետո՝ ելք, քանի որ դուռը, որտեղ նա ներս է մտել, ինչ-որ մեկը կողպել է Mystery Subway Escape 2-ում: Ըստ երևույթին նրանք հետևում էին նրան և որոշեցին ազատվել բծախնդիր հետախույզից։
