Մի երիտասարդ տղա ՝ Կիոտոն, միացավ նինձա մարտիկների գաղտնի հրամանին: Նրան ուղարկեցին լեռներ հատուկ տաճարում, որտեղ գտնվում է Ակադեմիան, որտեղ մարզվում են բոլոր սկզբնական պատերազմները: Այսօր մեր հերոսը մարզում է անցկացրել, և դուք կօգնեք նրան վարել նրան Ninja Academy խաղում: Էկրանի վրա ձեր առջև կտեսնեք ձեր հերոսին, որը կանգնած է տաճարի բակում: Դրա տակ տեղադրվելու է հսկիչ բանալիներով հատուկ վահանակ: Նրա օգնությամբ դուք կուղղորդեք ձեր հերոսի գործողությունները: Օբյեկտները կհայտնվեն նրա առջեւ տարբեր կողմերից: Դուք, առաջնորդելով հերոսին, ստիպված կլինեք ճշգրիտ հարվածներ հասցնել նրանց ձեռքի կամ ոտքի օգնությամբ: Ձեր յուրաքանչյուր ճշգրիտ հարվածը ձեզ որոշակի միավորներ կբերի: Հարվածները վարժեցնելուց հետո կանցնեք տարբեր տեխնիկայի մշակման:
